바이오 창업기업 제약사 협업과제 모집 (최대1억원·신청자격·11월2일)

2026 바이오 창업기업 제약사 협업과제 최대 1억원 지원 안내 이미지


국내 제약사와 공동으로 신약개발 기술을 검증하거나 바이오 연구성과를 사업화하려는 창업기업을 위한 정부 지원사업이 발표됐습니다. 중소벤처기업부와 창업진흥원은 2026년 제2차 민관협력 오픈이노베이션 상호 자율탐색형 바이오 분야 참여기업을 모집합니다.

최종 선정되는 바이오 창업기업은 제약사 등 수요기업과 함께 협업과제를 수행하면서 과제당 최대 1억 원의 사업화 자금을 지원받을 수 있습니다. 선정규모는 창업기업 약 10개사이며, 협약 이후 최대 7개월 동안 공동연구와 기술검증 등을 추진하게 됩니다.

하지만 신청일정을 확인할 때 반드시 주의해야 할 부분이 있습니다. 공식적인 협업제안서 제출 마감일은 2026년 11월 2일 오후 4시이지만, 그 전에 필요한 OI마켓 Pooling 신청은 10월 21일 오후 4시에 이미 마감됐습니다.

따라서 현재 시점에는 Pooling 신청을 기한 내 완료한 기업만 협업제안서를 제출할 수 있습니다. 이번 사업의 지원대상과 사업화 자금, 협업기술 분야, 선정절차, 제출서류 및 신청 시 주의사항을 살펴보겠습니다.

📌 바이오 창업기업 협업과제 핵심정보

사업명: 2026년 제2차 민관협력 오픈이노베이션 상호 자율탐색형(바이오 분야)

주관부처: 중소벤처기업부

전문기관: 창업진흥원

주관기관: 충북창조경제혁신센터

협력기관: 한국혁신의약품컨소시엄

지원대상: 창업 7년 이내 또는 신산업 분야 창업 10년 이내 기업

선정규모: 창업기업 10개사 내외

사업화 자금: 과제당 최대 1억 원

사업기간: 협약 시작일부터 7개월 이내

Pooling 신청: 2026년 10월 21일 16시 마감

협업제안서: 2026년 11월 2일 16시 마감

신청방법: OI마켓 사전신청 후 K-Startup 협업제안서 제출

⚠️ 10월 25일 기준 신청상태

1단계 OI마켓 Pooling 신청은 10월 21일 오후 4시에 마감됐습니다.

2단계 협업제안서는 11월 2일 오후 4시까지 제출할 수 있습니다.

Pooling 신청서를 제출하지 않은 기업은 협업제안서를 제출할 수 없습니다.

1. 바이오 오픈이노베이션, 제약사 협업사업 개요

이번 사업은 바이오 분야 대기업·중견기업과 기술력을 보유한 창업기업이 서로 적합한 협력 상대를 찾아 공동과제를 추진하도록 지원하는 프로그램입니다. 일반적인 창업지원사업과 달리 수요기업과 창업기업의 실제 협업관계를 중심으로 운영합니다.

수요기업은 국내 제약사 등 바이오 분야에서 새로운 기술이나 연구개발 역량을 필요로 하는 기업입니다. 창업기업은 자체 기술과 연구성과를 바탕으로 수요기업의 협업과제를 함께 수행할 수 있는 기업을 의미합니다.

사업명에 포함된 상호 자율탐색형은 양측이 OI마켓 플랫폼을 활용해 기술수요와 보유기술을 확인하고, 협력 가능성이 있는 기업을 자율적으로 탐색하는 방식을 뜻합니다. 필요하면 일대일 밋업을 통해 협업범위와 추진계획을 구체화할 수 있습니다.

이후 수요기업과 창업기업이 협업제안서를 공동 작성하고, 창업기업이 K-Startup을 통해 제출합니다. 최종 선정된 창업기업에는 사업화 자금과 후속 연계 지원이 제공됩니다.

2. 창업기업 신청자격, 7년 이내와 10년 이내 기준

창업기업의 기본 신청자격은 모집공고일인 2026년 10월 1일을 기준으로 창업 후 7년 이내인 기업입니다. 신산업 분야에 해당하는 창업기업은 창업 후 10년 이내까지 신청할 수 있도록 별도 기준을 적용합니다.

창업기간은 중소기업창업 지원법에 따른 창업일을 기준으로 판단합니다. 단순히 사업자등록증에 기재된 날짜만으로 모든 경우의 창업기간을 판단할 수 있는 것은 아니므로 창업기업 확인서와 공고문의 세부기준을 함께 확인해야 합니다.

바이오 분야 기술을 보유하고 있더라도 창업기간이나 기업유형 등 필수요건을 충족하지 못하면 신청이 제한될 수 있습니다. 또한 정부 창업지원사업 참여제한 등 공고에서 정한 제외사유에 해당하는 기업도 평가대상에서 제외됩니다.

수요기업은 국내 제약사 등 바이오 분야 대기업과 중견기업을 중심으로 모집합니다. 창업기업과 달리 수요기업에는 사업화 지원금이 직접 지급되지 않으며, 협업기술 발굴과 공동연구를 통해 사업에 참여합니다.

🏢 기업별 참여기준

일반 창업기업: 공고일 기준 창업 7년 이내

신산업 분야 창업기업: 창업 10년 이내

수요기업: 국내 제약사 등 바이오 분야 대·중견기업

지원금 지급대상: 최종 선정된 창업기업

3. 협업기술, 신약개발과 AI 바이오 분야

이번 모집은 제약사와 바이오 창업기업이 공동으로 기술을 개발하거나 검증할 수 있는 분야를 대상으로 합니다. 특히 혁신 신약 후보물질, 차세대 치료기술, 인공지능과 바이오데이터를 활용한 신약개발 기술 등이 주요 협업분야로 제시됐습니다.

첫 번째 분야는 혁신 신약 후보물질 공동연구입니다. 제약사가 필요로 하는 치료영역과 창업기업이 보유한 후보물질이나 플랫폼 기술을 연결해 공동연구를 추진하는 방식입니다.

두 번째는 신규 타깃과 새로운 작용기전인 Novel MOA를 기반으로 하는 신약 후보물질 및 플랫폼 기술입니다. 기존 접근방식과 차별화된 치료표적이나 약물 작용기전을 연구하는 기업이 관련 협업 가능성을 검토할 수 있습니다.

세 번째는 차세대 모달리티 기술입니다. 새로운 의약품 개발방식과 치료 플랫폼을 활용하는 기술이 포함될 수 있으며, 실제 협업 가능성은 수요기업의 기술수요와 공고상 인정범위에 따라 판단합니다.

이 밖에도 AI·바이오데이터 기반 신약개발, 후보물질 발굴 및 검증, 전임상 평가기술 등 신약개발 효율을 높이는 기술이 모집대상에 포함됩니다. 창업기업은 자사의 기술이 어떤 수요기업의 문제를 해결할 수 있는지 구체적으로 설명해야 합니다.

4. 사업화 자금, 과제당 최대 1억원 지원

최종 선정된 바이오 창업기업에는 수요기업과의 협업과제 추진에 필요한 사업화 자금이 과제당 최대 1억 원까지 지원됩니다. 선정규모는 창업기업 10개사 내외로 안내되어 있습니다.

지원금은 창업기업이 협업과제를 수행하기 위한 사업화 자금입니다. 모든 신청기업이 1억 원을 받는 것은 아니며, 선정평가 결과와 정부지원사업비 심의를 거쳐 기업별 지원금액이 확정됩니다.

협업과제는 수요기업과 창업기업이 공동으로 추진목표와 수행범위, 역할분담 등을 설정해야 합니다. 따라서 단순한 기술소개서보다 실제 검증 가능한 목표와 수행계획을 제시하는 것이 중요합니다.

사업기간은 협약 시작일부터 7개월 이내이며, 예정된 수행기간은 2026년 12월부터 2027년 6월까지입니다. 사업기간과 평가일정은 운영상황에 따라 조정될 수 있습니다.

사업화 자금 외에도 수요기업과의 협업을 통한 후속 연계 지원이 제공됩니다. 다만 후속 투자나 기술도입이 자동으로 보장되는 것은 아니며, 협업성과와 참여기관의 후속 검토에 따라 달라집니다.

💰 지원내용 요약

선정규모: 창업기업 약 10개사

사업화 자금: 과제당 최대 1억 원

수행기간: 협약 시작일부터 7개월 이내

지원대상: 최종 선정 창업기업

후속지원: 협업성과에 따른 연계 지원

5. 신청기간, 10월 21일과 11월 2일 구분

이번 사업은 신청기간이 두 단계로 나뉘기 때문에 마감일을 혼동하지 않아야 합니다. 첫 번째 단계는 OI마켓 Pooling 신청이며, 2026년 10월 21일 오후 4시에 마감됐습니다.

Pooling 신청서는 수요기업과 창업기업이 각자의 기업정보와 협업수요를 등록하는 단계입니다. 해당 자료는 상호 탐색을 위한 정보로 활용되며, 자체적으로 선정평가를 받는 단계는 아닙니다.

두 번째 단계는 협업제안서 제출입니다. 마감일은 2026년 11월 2일 오후 4시이며, 수요기업과 창업기업이 공동으로 작성한 협업제안서를 창업기업 대표자가 K-Startup에 제출해야 합니다.

중요한 점은 Pooling 신청을 하지 않은 기업은 협업제안서를 제출할 수 없다는 사실입니다. 따라서 10월 21일 이전에 선행신청을 완료하지 않은 기업은 11월 2일 마감만 보고 신규 신청을 진행할 수 없습니다.

기한 내 Pooling 신청을 완료한 기업이라면 협업 상대와 제안내용을 점검하고 K-Startup 제출절차를 준비해야 합니다. 신청 마감시각은 오후 4시 정각이므로 최종 제출완료 여부를 반드시 확인해야 합니다.

📅 신청일정 확인

1단계: OI마켓 Pooling 신청

마감: 2026년 10월 21일 16:00

상태: 마감

2단계: K-Startup 협업제안서 제출

마감: 2026년 11월 2일 16:00

대상: Pooling 신청을 완료한 기업

6. 신청방법, OI마켓과 K-Startup 제출절차

신청절차는 OI마켓 Pooling 등록, 상호 자율탐색, 필요 시 일대일 밋업, 협업제안서 공동 작성, K-Startup 온라인 제출 순서로 진행됩니다.

먼저 수요기업과 창업기업은 OI마켓에 각각 Pooling 신청서를 제출해야 합니다. 신청기업은 플랫폼에 등록된 협업수요와 기업정보를 확인하고 적합한 협업 상대를 탐색합니다.

이후 필요하면 온·오프라인 밋업을 진행할 수 있습니다. 밋업은 협업과제의 목표와 기술검증 범위, 양측의 역할을 조율하는 과정이며, 필수 참여사항은 아닙니다.

협업의사가 확인되면 수요기업과 창업기업이 협업제안서를 공동 작성합니다. 최종 제출은 창업기업 대표자가 K-Startup 온라인 신청 시스템에서 진행해야 합니다.

K-Startup에서는 회원가입과 실명인증, 기업인증 등의 절차가 필요할 수 있습니다. 대표자 본인이 신청해야 하며, 대리신청은 탈락 사유가 될 수 있으므로 제출 주체를 정확히 확인해야 합니다.

협업제안서는 공고문에서 지정한 양식을 사용해야 합니다. 다른 양식으로 제출하면 평가대상에서 제외될 수 있으므로 제출 전에 공식 모집공고의 첨부서류를 확인해야 합니다.

7. 제출서류, 창업기업 확인서와 협업제안서

창업기업은 온라인 사업신청서와 협업제안서, 법인등기사항전부증명서 등 공고에서 요구하는 자료를 준비해야 합니다. 신분확인과 사업자등록 관련 서류는 공공마이데이터 활용 여부에 따라 제출방식이 달라질 수 있습니다.

창업 7년 이내 기업은 창업기업 확인서 제출이 필수입니다. 확인서는 창업기업 확인시스템을 통해 발급받아야 하며, 발급에 시간이 걸릴 수 있으므로 신청 전에 준비하는 것이 중요합니다.

협업제안서는 수요기업과 창업기업이 공동으로 작성하되 최종 신청은 창업기업이 진행합니다. 협업목표, 추진체계, 기술검증 방법, 결과물, 수행가능성 등을 구체적으로 작성해야 합니다.

온라인 신청서 작성만으로 접수가 완료되는 것은 아닙니다. 최종적으로 제출완료 버튼을 클릭해야 접수가 인정되므로 마감일 이전에 제출상태를 확인해야 합니다.

8. 선정절차, 서류평가와 발표평가 기준

협업제안서 접수가 완료되면 신청자격과 제출서류를 확인하는 요건검토가 진행됩니다. 이후 서류평가와 발표평가를 거쳐 최종 지원기업을 선정합니다.

서류평가는 수요기업과 창업기업이 공동으로 작성한 협업제안서를 기준으로 진행하며, 발표평가 대상은 선정규모의 약 2배수 이내에서 정해질 수 있습니다. 신청규모에 따라 서류평가가 생략될 가능성도 있습니다.

발표평가는 창업기업 대표자가 참석하는 것을 원칙으로 합니다. 사업계획 발표와 질의응답을 통해 협업과제의 필요성, 기술적 실현가능성, 수행역량 등을 종합적으로 확인합니다.

평가에서는 사업에 대한 이해도와 협업과제의 구체성, 실제 구현 가능성, 양측 기업의 협력 가능성이 중요하게 다뤄집니다. 비수도권 소재 신청기업에는 공고상 가점 2점이 적용됩니다.

최종 선정 이후에도 정부지원사업비 심의를 통해 기업별 지원금액이 달라질 수 있습니다. 선정기업은 정해진 기한 안에 협약체결확약서를 제출해야 하며, 관련 절차를 이행하지 않으면 선정이 취소될 수 있습니다.

⚠️ 신청기업 주의사항

① Pooling 신청 완료 여부 확인

② 창업 7년 또는 신산업 10년 이내 요건 확인

③ 수요기업과 협업제안서 공동 작성

④ 창업기업 대표자 본인 신청

⑤ 창업기업 확인서와 지정 양식 준비

⑥ 11월 2일 오후 4시 이전 최종 제출

⑦ 정부지원사업 중복수혜 제한 및 협약조건 확인

❓ 자주 묻는 질문 FAQ

Q1. 바이오 창업기업은 최대 얼마까지 지원받나요?

최종 선정된 창업기업은 협업과제 추진을 위한 사업화 자금을 과제당 최대 1억 원까지 지원받을 수 있습니다.

Q2. 창업한 지 8년이 된 기업도 신청할 수 있나요?

신산업 분야 창업기업에 해당하면 창업 10년 이내 기준을 적용받을 수 있습니다. 세부 인정요건은 공고문을 확인해야 합니다.

Q3. 11월 2일까지 처음 신청해도 되나요?

아닙니다. 10월 21일까지 OI마켓 Pooling 신청을 완료한 기업만 협업제안서를 제출할 수 있습니다.

Q4. 제약사도 최대 1억 원을 받나요?

아닙니다. 사업화 자금은 최종 선정된 창업기업에 지원되며, 수요기업에 직접 지급되는 지원금은 아닙니다.

Q5. 오프라인 밋업에 반드시 참여해야 하나요?

아닙니다. 밋업은 필요에 따라 참여할 수 있으며 필수 절차는 아닙니다.

Q6. 협업제안서는 어디에 제출하나요?

수요기업과 공동 작성한 협업제안서를 창업기업 대표자가 K-Startup 온라인 시스템에 제출해야 합니다.

📌 핵심 정리

2026년 제2차 민관협력 오픈이노베이션 바이오 분야 모집은 국내 제약사 등 수요기업과 바이오 창업기업의 공동연구 및 기술검증을 지원하는 사업입니다. 창업기업 약 10개사를 선정하며, 과제당 최대 1억 원의 사업화 자금을 지원합니다.

일반 창업기업은 창업 7년 이내, 신산업 분야 창업기업은 창업 10년 이내 기준이 적용됩니다. 주요 협업분야는 신약 후보물질, 차세대 모달리티, AI·바이오데이터 기반 신약개발, 전임상 평가기술 등입니다.

현재 가장 중요한 사항은 신청단계별 마감일입니다. OI마켓 Pooling 신청은 10월 21일 이미 종료됐으며, 이를 완료한 기업만 11월 2일 오후 4시까지 협업제안서를 제출할 수 있습니다. 신청기업은 공식 공고문의 자격요건과 제출서류를 최종 확인해야 합니다.

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📚 공식 참고자료

① 중소벤처기업부 모집공고

2026년 제2차 민관협력 오픈이노베이션 상호 자율탐색형(바이오 분야) 참여기업 모집공고
중소벤처기업부 공식 공고 확인

② 국가생명공학정책연구센터 BioIN

참여대상, 협업기술, 사업화 자금 및 신청일정 안내
BioIN 사업공고 확인

③ OI마켓

수요기업·창업기업 Pooling 및 협업기업 탐색 플랫폼
OI마켓 홈페이지

④ K-Startup

협업제안서 온라인 신청 및 창업지원사업 공고 확인
K-Startup 홈페이지

⑤ 사업 문의

충북창조경제혁신센터 043-710-5932

한국혁신의약품컨소시엄 02-6247-0918

온라인 신청·시스템 문의 국번 없이 1357